一客运公司将该公司的一客运车辆及线路牌承包给乙经营,约定乙每年交纳承包费100000元,在合同履行期间,乙没有向客运公司交纳承包费100000元,客运公司提起诉讼。
在确定民事案由时,存在二种意见,一是定性为运输合同纠纷,一是定性为与企业有关的纠纷。
请问该案如何确定民事案由?